Het onderwijsprincipe is dat leerlingen door ervaring leren hoe verschijnselen en processen in de natuur in elkaar zitten. Het didactisch model bestaat uit een vijftal fasen: introductiefase, activiteitenfase, ordeningsfase, verwerkingsfase, evaluatiefase. De onderwerpen die in het natuuronderwijs van de basisschool aan bod komen kunnen volgens de 'Natuur-nabij' methode in 6 thema's ondergebracht worden: wijzelf, planten, dieren, compartimenten, materialen, en omgeving. Binnen het aanbod van het documentatiecentrum zijn één of meerdere leskisten per thema beschikbaar.

Het documentatiecentrum werkt nauw samen met de onderwijsmakelaar van het Milieu Educatie Centrum Nijmegen. De onderwijsmakelaar verzorgt aan het begin van elk nieuw schooljaar voor meer dan dertig basisscholen in de regio Nijmegen de planning van de inzet van leskisten van het Natuurmuseum in hun jaarprogramma natuuronderwijs. Natuurlijk kunnen scholen in de regio Nijmegen ook direct bij het documentatiecentrum van het Natuurmuseum terecht om informatie in te winnen over lesmaterialen. Daarnaast kan rechtstreeks lesmateriaal worden gereserveerd voor gebruik op school. Wilt u in de loop van het schooljaar nog (extra) leskisten reserveren, doe dit dan altijd zo vroeg mogelijk om teleurstelling te voorkomen. Veel leskisten zijn al aan het begin van het schooljaar vrijwel voor de hele periode gereserveerd.

In de meeste gevallen is een leskist specifiek samengesteld voor één of enkele leerjaren in het basisonderwijs. Bij elke leskist is een docentenhandleiding met een lesprogramma en werkbladen toegevoegd. De materialen die nodig zijn voor de uitvoering van het lesprogramma zijn, in zoverre dit praktisch mogelijk is, toegevoegd. Dit kunnen objecten zijn uit de museumcollectie, die de leerkracht tijdens de lessen kan laten zien, of tijdelijk een plekje kan geven op de thematafel. Maar het kunnen ook 35 materialendoosjes zijn, waarmee een leerkracht de leerlingen zelfstandig schakelingen kan laten bouwen.